Este comando recortará el video de la posición 00:00:30 (es decir, 30 segundos después del inicio del video) hasta la posición 00:01:00 (es decir, 1 minuto después del inicio del video), y guardará el resultado en un nuevo archivo llamado output.mp4.
ffmpeg -i input.mp4 -ss 00:00:30 -to 00:01:00 -c copy output.mp4
Si quieres especificar solo el inicio o solo el final del clip a recortar, puedes usar -ss para especificar el inicio y omitir -to, o usar -to para especificar el final y omitir -ss.